Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDCA8Q53HL2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms