Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms