Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms