Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KHDC1Q4VXA5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms