Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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KRTAP27-1Q3LI81 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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