Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms