Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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