Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms