Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FXNQ16595 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FXNQ16595 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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