Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms