Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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