Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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