Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPRHQ149N8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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