Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB1Q14028 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms