Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHROOM2Q13796 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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