Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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