Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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