Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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