Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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