Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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