Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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