Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KIF1AQ12756 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms