Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPAL4Q0D2K0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms