Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms