Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms