Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms