Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms