Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms