Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTRA4P83105 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms