Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN10P78369 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN10P78369 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms