Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVFRD-1P60508 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms