Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms