Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms