Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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