Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTAP49354 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms