Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ME1P48163 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms