Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms