Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPA9P38646 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPA9P38646 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPA9P38646 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms