Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms