Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB2P29033 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms