Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms