Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO2P25791 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms