Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms