Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRGP23470 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms