Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms