Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms