Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms