Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms