Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms