Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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